José D. Faraldo-Gómez: шукати на сайті Z-Library

Найбільша колекція наукових статей у сіті. 70,000,000+ безкоштовних статей.

Пожертвування 15 вересня 2024 – 1 жовтня 2024

Z-Library - одна з найбільших онлайн-бібліотек у світі, в якій зберігається більше 17,000,000 книг та 84,837,000 статей. Ми намагаємось зробити літературу доступною кожному. Сьогодні (15 вересня 2024) ми відкриваємо додатковий збір пожертвувань на підтримку та розвиток проекту.

Також БЕЗЛІМТНІ завантаження (протягом 31 дня після завершення пожертвування) доступні для ВСІХ користувачів, які підтримають проект в період збору коштів до 1 жовтня 2024.

Про збір коштів Детальніше

Підтримати

Dear readers,there is a temporary problem with downloading books on the site. Our specialists are trying to do everything possible to restore this function. We apologize for the inconvenience

Книги
Статті (90)
Найпопулярніші
Перелік
- Перелік
- Таблиця

A New Molecular-Mechanics Model for Simulations of Hydrogen Fluoride in Chemistry and Biology

Orabi, Esam A., Faraldo-Gomez, Jose D.

Журнал:

Journal of Chemical Theory and Computation

Рік:

2020

Файл:

PDF, 27.17 MB

2020

Acquisition of siderophores in gram-negative bacteria

Faraldo-Gómez, José D., Sansom, Mark S. P.

Журнал:

Nature Reviews Molecular Cell Biology

Рік:

2003

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.74 MB

english, 2003

Insights into the mechanism of the Na+/Ca2+ exchanger from atomistic molecular dynamics simulations

Marinelli, Fabrizio, Faraldo-Gómez, José D.

Журнал:

Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Bioenergetics

Рік:

2012

Мова:

english

Файл:

PDF, 57 KB

english, 2012

Sodium recognition by the Na + /Ca 2+ exchanger in the outward-facing conformation

Marinelli, Fabrizio, Almagor, Lior, Hiller, Reuben, Giladi, Moshe, Khananshvili, Daniel, Faraldo-Gómez, José D.

Журнал:

Proceedings of the National Academy of Sciences

Рік:

2014

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.42 MB

english, 2014

How the Substrate Occupancy of a Membrane Transporter Determines the Viability of its Alternating-Access Mechanism and thus its Functional Specificity

Marinelli, Fabrizio, Ficici, Emel, Faraldo-Gómez, José

Журнал:

Biophysical Journal

Рік:

2018

Мова:

english

Файл:

PDF, 47 KB

english, 2018

Natural variations at position 93 of the invariant Vα24-Jα18 α chain of human iNKT-cell TCRs strongly impact on CD1d binding

Joseph P. Sanderson, Kathrin Waldburger-Hauri, Diana Garzón, Gediminas Matulis, Salah Mansour, Nicholas J. Pumphrey, Nikolai Lissin, Peter M. Villiger, Bent Jakobsen, José D. Faraldo-Gómez, Stephan D.

Журнал:

European Journal of Immunology

Рік:

2012

Мова:

english

Файл:

PDF, 278 KB

english, 2012

Characterization of conformational equilibria through Hamiltonian and temperature replica-exchange simulations: Assessing entropic and environmental effects

José D. Faraldo-Gómez, Benoît Roux

Журнал:

Journal of Computational Chemistry

Рік:

2007

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.03 MB

english, 2007

Polarizable model of chloroform based on classical Drude oscillators

Guillaume Lamoureux, José D. Faraldo-Gómez, Sergei Krupin, Sergei Yu. Noskov

Журнал:

Chemical Physics Letters

Рік:

2009

Мова:

english

Файл:

PDF, 210 KB

english, 2009

The 2.5 Å Structure of CD1c in Complex with a Mycobacterial Lipid Reveals an Open Groove Ideally Suited for Diverse Antigen Presentation

Louise Scharf, Nan-Sheng Li, Andrew J. Hawk, Diana Garzón, Tejia Zhang, Lisa M. Fox, Allison R. Kazen, Sneha Shah, Esmael J. Haddadian, Jenny E. Gumperz, Alan Saghatelian, José D. Faraldo-Gómez, Steph

Журнал:

Immunity

Рік:

2010

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.26 MB

english, 2010

Conformational sampling and dynamics of membrane proteins from 10-nanosecond computer simulations

José D. Faraldo-Gómez, Lucy R. Forrest, Marc Baaden, Peter J. Bond, Carmen Domene, George Patargias, Jonathan Cuthbertson, Mark S.P. Sansom

Журнал:

Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics

Рік:

2004

Мова:

english

Файл:

PDF, 475 KB

english, 2004

Setting up and optimization of membrane protein simulations

José D. Faraldo-Gómez, Graham R. Smith, Mark S. Sansom

Журнал:

European Biophysics Journal

Рік:

2002

Мова:

english

Файл:

PDF, 446 KB

english, 2002

Microscopic rotary mechanism of ion translocation in the Fo complex of ATP synthases

Pogoryelov, Denys, Krah, Alexander, Langer, Julian D, Yildiz, Özkan, Faraldo-Gómez, José D, Meier, Thomas

Журнал:

Nature Chemical Biology

Рік:

2010

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.72 MB

english, 2010

High-resolution structure of the rotor ring of a proton-dependent ATP synthase

Pogoryelov, Denys, Yildiz, Özkan, Faraldo-Gómez, José D, Meier, Thomas

Журнал:

Nature Structural and Molecular Biology

Рік:

2009

Мова:

english

Файл:

PDF, 989 KB

english, 2009

Structural and energetic basis for H+ versus Na+ binding selectivity in ATP synthase Fo rotors

Alexander Krah, Denys Pogoryelov, Julian D. Langer, Peter J. Bond, Thomas Meier, José D. Faraldo-Gómez

Журнал:

Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Bioenergetics

Рік:

2010

Мова:

english

Файл:

PDF, 3.66 MB

english, 2010

Structural basis for the ion selectivity of F-ATP-synthase c-ring rotors

Alexander Krah, Denys Pogoryelov, Julian Langer, Peter J. Bond, Thomas Meier, José D. Faraldo-Gómez

Журнал:

Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Bioenergetics

Рік:

2010

Мова:

english

Файл:

PDF, 61 KB

english, 2010

On the rotary mechanism of F1FO-ATP synthases

Denys Pogoryelov, Alexander Krah, Julian Langer, José D. Faraldo-Gómez, Thomas Meier

Журнал:

Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Bioenergetics

Рік:

2010

Мова:

english

Файл:

PDF, 60 KB

english, 2010

Mechanism of selective Na+ or H+ binding and coupled rotation in F1FO ATP synthases: Insights from quantitative computer simulations

José D. Faraldo-Gómez

Журнал:

Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Bioenergetics

Рік:

2010

Мова:

english

Файл:

PDF, 118 KB

english, 2010

Modeling and simulation of ion-coupled and ATP-driven membrane proteins

José D Faraldo-Gómez, Lucy R Forrest

Журнал:

Current Opinion in Structural Biology

Рік:

2011

Мова:

english

Файл:

PDF, 835 KB

english, 2011

Electrostatics of Ion Stabilization in a ClC Chloride Channel Homologue from Escherichia coli

José D. Faraldo-Gómez, Benoı̂t Roux

Журнал:

Journal of Molecular Biology

Рік:

2004

Мова:

english

Файл:

PDF, 3.13 MB

english, 2004

Mechanism of Intracellular Block of the KcsA K+ Channel by Tetrabutylammonium: Insights from X-ray Crystallography, Electrophysiology and Replica-exchange Molecular Dynamics Simulations

José D. Faraldo-Gómez, Esin Kutluay, Vishwanath Jogini, Yanxiang Zhao, Lise Heginbotham, Benoît Roux

Журнал:

Journal of Molecular Biology

Рік:

2007

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.69 MB

english, 2007

Complete Ion-Coordination Structure in the Rotor Ring of Na+-Dependent F-ATP Synthases

Thomas Meier, Alexander Krah, Peter J. Bond, Denys Pogoryelov, Kay Diederichs, José D. Faraldo-Gómez

Журнал:

Journal of Molecular Biology

Рік:

2009

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.61 MB

english, 2009

On the Structure of the Proton-Binding Site in the Fo Rotor of Chloroplast ATP Synthases

Alexander Krah, Denys Pogoryelov, Thomas Meier, José D. Faraldo-Gómez

Журнал:

Journal of Molecular Biology

Рік:

2010

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.82 MB

english, 2010

Predicted structural basis for CD1c presentation of mycobacterial branched polyketides and long lipopeptide antigens

Diana Garzón, Peter J. Bond, José D. Faraldo-Gómez

Журнал:

Molecular Immunology

Рік:

2009

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.90 MB

english, 2009

OmpA: A Pore or Not a Pore? Simulation and Modeling Studies

Bond, Peter J., Faraldo-Gómez, José D., Sansom, Mark S.P.

Журнал:

Biophysical Journal

Рік:

2002

Мова:

english

Файл:

PDF, 545 KB

english, 2002

Molecular Dynamics Simulations of the Bacterial Outer Membrane Protein FhuA: A Comparative Study of the Ferrichrome-Free and Bound States

Faraldo-Gómez, José D., Smith, Graham R., Sansom, Mark S.P.

Журнал:

Biophysical Journal

Рік:

2003

Мова:

english

Файл:

PDF, 824 KB

english, 2003

On the Question of Hydronium Binding to ATP-Synthase Membrane Rotors

Leone, Vanessa, Krah, Alexander, Faraldo-Gómez, José D.

Журнал:

Biophysical Journal

Рік:

2010

Мова:

english

Файл:

PDF, 488 KB

english, 2010

Griffin: A Versatile Methodology for Optimization of Protein-Lipid Interfaces for Membrane-Protein Simulations

Staritzbichler, René, Anselmi, Claudio, Forrest, Lucy R., Faraldo-Gómez, José D.

Журнал:

Biophysical Journal

Рік:

2011

Мова:

english

Файл:

PDF, 36 KB

english, 2011

String Method for Calculation of Minimum Free-Energy Paths in Cartesian Space in Freely Tumbling Systems

Branduardi, Davide, Faraldo-Gómez, José D.

Журнал:

Journal of Chemical Theory and Computation

Рік:

2013

Мова:

english

Файл:

PDF, 3.83 MB

english, 2013

High-resolution structure of a Na+-driven ATP synthase rotor ring with a two-carboxylate ion-binding motif

Schulz, Sarah, Krah, Alexander, Yildiz, Özkan, Faraldo-Gómez, José D., Meier, Thomas

Журнал:

Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Bioenergetics

Рік:

2012

Мова:

english

Файл:

PDF, 71 KB

english, 2012

Enhanced Substrate Release from a TRAP Transporter Binding Protein by Remote Modulation of its Intrinsic Conformational Dynamics

Marinelli, Fabrizio, Kuhlmann, Sonja I., Grell, Ernst, Bienert, Ralf, Kunte, Hans-Jörg, Ziegler, Christine, Faraldo-Gómez, José D.

Журнал:

Biophysical Journal

Рік:

2011

Мова:

english

Файл:

PDF, 35 KB

english, 2011

Automated and Optimized Embedding of Proteins into Membranes for Molecular Dynamics Simulations using Griffin

Staritzbichler, René, Forrest, Lucy R., Faraldo-Gómez, José D.

Журнал:

Biophysical Journal

Рік:

2010

Мова:

english

Файл:

PDF, 37 KB

english, 2010

Investigation of the Regulatory Mechanism of the ZAP-70 Immunological Signaling Enzyme

Bond, Peter J., Faraldo-Gómez, Josè D.

Журнал:

Biophysical Journal

Рік:

2009

Мова:

english

Файл:

PDF, 118 KB

english, 2009

Asymmetric Dynamics of the Acyl-Carrier Protein Inside the Fungal Fatty-Acid Mega-Synthase

Anselmi, Claudio, Faraldo-Gómez, José D.

Журнал:

Biophysical Journal

Рік:

2010

Мова:

english

Файл:

PDF, 38 KB

english, 2010

Structural and Physiological Factors Controlling the Ion Specificity of ATP Synthase Membrane Rotors

Faraldo-Gómez, José D., Krah, Alexander, Leone, Vanessa, Rössler, Florian

Журнал:

Biophysical Journal

Рік:

2011

Мова:

english

Файл:

PDF, 44 KB

english, 2011

Revisiting Boyer's Hydronium Hypothesis: On the Mechanism of Proton Binding to ATP Synthase Membrane Rotors

Leone, Vanessa, Krah, Alexander, Faraldo-Gómez, José D.

Журнал:

Biophysical Journal

Рік:

2011

Мова:

english

Файл:

PDF, 44 KB

english, 2011

Structural Basis for Regulation Specificity in Syk-Family Kinases

Bond, Peter J., Faraldo-Gómez, José D.

Журнал:

Biophysical Journal

Рік:

2010

Мова:

english

Файл:

PDF, 39 KB

english, 2010

Experimental Determination of the Ion Selectivity of an ATP-Synthase Membrane Rotor by Isothermal Titration Calorimetry

Leone, Vanessa, Pogoryelov, Denys, Meier, Thomas, Grell, Ernst, Faraldo-Gómez, José D.

Журнал:

Biophysical Journal

Рік:

2014

Мова:

english

Файл:

PDF, 47 KB

english, 2014

Specificity, mechanism and membrane organization of ATP synthases

Faraldo-Gómez, José D.

Журнал:

Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Bioenergetics

Рік:

2012

Мова:

english

Файл:

PDF, 121 KB

english, 2012

Tuning the ion specificity of the ATP synthase rotor

Krasnoselska, Ganna O., Pogoryelov, Denys, Krah, Alexander, Langer, Julian D., Faraldo-Gómez, José D., Meier, Thomas

Журнал:

Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Bioenergetics

Рік:

2012

Мова:

english

Файл:

PDF, 74 KB

english, 2012

Engineering rotor ring stoichiometries in the ATP synthase

Pogoryelov, Denys, Klyszejko, Adriana L., Krasnoselska, Ganna O., Heller, Eva-Maria, Leone, Vanessa, Langer, Julian D., Vonck, Janet, Muller, Daniel J., Faraldo-Gómez, José D., Meier, Thomas

Журнал:

Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Bioenergetics

Рік:

2012

Мова:

english

Файл:

PDF, 79 KB

english, 2012

Automated Protein-Insertion into Membranes for Molecular Dynamics Simulation Set-Up Using Taragrid

Staritzbichler, René, Forrest, Lucy R., Faraldo-Gómez, José

Журнал:

Biophysical Journal

Рік:

2010

Мова:

english

Файл:

PDF, 40 KB

english, 2010

On the Functional Differentiation of F- and V-Type Rotary Atpases Atomic Mechanism of a Hybrid F/V Membrane Rotor

Zhou, Wenchang, Matthies, Doreeen, Anselmi, Claudio, Meier, Thomas, Faraldo-Gómez, José D.

Журнал:

Biophysical Journal

Рік:

2014

Мова:

english

Файл:

PDF, 47 KB

english, 2014

A hydrophilic environment enhances opening and deprotonation of the binding sites in the membrane rotor of a mitochondrial ATP synthase

Krah, Alexander, Faraldo-Gómez, José D.

Журнал:

Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Bioenergetics

Рік:

2012

Мова:

english

Файл:

PDF, 89 KB

english, 2012

Predicted topology of the ion-conducting subunit-a of the membrane motor of the ATP synthase

Leone, Vanessa, Fillingame, Robert H., Faraldo-Gómez, José D.

Журнал:

Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Bioenergetics

Рік:

2012

Мова:

english

Файл:

PDF, 70 KB

english, 2012

Molecular Basis for Sodium Versus Calcium Binding in the Sodium-Calcium Exchanger

Marinelli, Fabrizio, Faraldo-Gómez, José D.

Журнал:

Biophysical Journal

Рік:

2014

Мова:

english

Файл:

PDF, 49 KB

english, 2014

On How the Conformational Cycle of the AcrB Efflux Pump is Coupled to Proton Translocation: A Theoretical Study Based on High-Resolution Structural Data

Anselmi, Claudio, Zhou, Wenchang, Diederichs, Kay, Pos, Klaas M., Faraldo-Gómez, José D.

Журнал:

Biophysical Journal

Рік:

2011

Мова:

english

Файл:

PDF, 62 KB

english, 2011

Alternating-Access Mechanism of the Proton-Drug Antiporter AcrB

Anselmi, Claudio, Zhou, Wenchang, Pos, K. Martin, Faraldo-Gomez, Jose D.

Журнал:

Biophysical Journal

Рік:

2014

Мова:

english

Файл:

PDF, 60 KB

english, 2014

Mechanisms of Selective Sodium/Proton Binding and Coupled Rotation in F1fo ATP Synthases: Insights from Quantitative Computer Simulations

Krah, Alexander, Bond, Peter J., Faraldo-Gómez, José D.

Журнал:

Biophysical Journal

Рік:

2010

Мова:

english

Файл:

PDF, 71 KB

english, 2010

Ceramide–lipid interactions studied by MD simulations and solid-state NMR

Dutagaci, Bercem, Becker-Baldus, Johanna, Faraldo-Gómez, José D., Glaubitz, Clemens

Журнал:

Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembranes

Рік:

2014

Мова:

english

Файл:

PDF, 3.25 MB

english, 2014

High-resolution structure and mechanism of an F/V-hybrid rotor ring in a Na+-coupled ATP synthase

Matthies, Doreen, Zhou, Wenchang, Klyszejko, Adriana L., Anselmi, Claudio, Yildiz, Özkan, Brandt, Karsten, Müller, Volker, Faraldo-Gómez, José D., Meier, Thomas

Журнал:

Nature Communications

Рік:

2014

Мова:

english

Файл:

PDF, 2.85 MB

english, 2014